Zgodba filma se nadaljuje takoj po koncu prvega in nam predstavi stare znance, kot so Ježek Sonic, Robotnik, družino Wachowski in tudi nova pomembna obraza. To sta Knuckles, ki je nasprotnik Sonica, in Tails, ki mu na poti pomaga. Pri nas je aktualna sinhronizirana verzija, zato ne bomo izgubljali veliko besed glede glasu, a treba je pripomniti, da se je franšizi kot Knuckles pridružil Idris Elba. Njegov način dostave stavkov je v originalni verziji lik še bolj poneumljal, kot je bilo to potrebno. Tails na drugi strani je bil odličen v vseh aspektih. Bil je najboljša stvar novega filma in Sonic 2 bi bil zelo pust, če bi predstavili zgolj Knucklesa.
Zgodba se osredotoča na Robotnika, ki se trudi z ježki pridobiti kristal, saj ta daje izjemno moč. Pri tem pridejo do kar nekaj realizacij in hitro se potek zgodbe spremeni v pripoved o prijateljstvu ter pomoči drug drugemu. Dialog je daleč najslabši del filma, saj so bili komični vložki katastrofalni v primerjavi s prvim filmom. Vsi poskusi dialoga so delovali zelo robotsko in umetno, tudi kadar so se pogovarjali odrasli. Jim Carrey je v vlogi Robotnika nadaljeval svojo ekscentričnost in je ponovno pustil svoj pečat, a bistveno manjšega v primerjavi s prvim filmom.